1. Layanan Administrasi diselenggarakan oleh tiga Biro:

• BAK – Biro Akademik dan Kemahasiswaan

Kepala BAK: Afra Tustini Ekawati, S. Pd., M. Si

1. Kabag Akademik : Drs. Edward Doran
   • Kasubbag Registrasi & Statistik : Isai Julianto, S.Kom
   • Kasubbag Akademik & Evaluasi : Muhammad Syahrian Noor, SP.
   • Kasubbag Sarana & Prasarana Pendidikan : Dra. Hj. Airawati
2. Kabag Kemahasiswaan : Abdul Khadir, S.Kom., M.Si
   • Kasubbag Minat, Penalaran & Informasi Kemahasiswaan : Ariyanto Budi Setyawan, S.Hut., M.Si
   • Kasubbag Kesejahteraan Mahasiswa : Hasyim, S.Sos

• BUK – Biro Umum dan Keuangan

Kepala: H. Bahriansyah, SH.,M.Si

1. Kabag Umum : Paijan,  S.Kom., M.Si
   • Kasubbag TU : Hj. Annisa Rahman, S.Hut., M.Si
   • Kasubbag HTL : Juari, SE., M.Si
   • Kasubbag BMN : Martono, SE
   • Kasubbag RT : Rahardiono, S.Sos., M.Si
2. Kabag Keuangan : Fajrian Nur Darmansyah, S.Sos., M.Si
   • Kasubbag PNBP : Azhari, S.E
   • Kasubbag Non PNBP : La Saemi, S.Sos
   • Kasubbag Akuntansi dan Pelaporan : Tri Sutrisno, S.Pd
3. Kabag Kepegawaian : Agus Soepriyadi, S.E., M.Si
   • Kasubbag Tenaga Pendidik : Sutikno, S.Sos., M.M
   • Kasubbag Tenaga Kependidikan : Nur Bambang B, S.Kom

• BPKH – Biro Perencanaan, Kerjasama dan Hubungan Masyarakat

Kepala: Sugiyarta, SE., M.Si

1. Kabag Perencanaan : Zia Ul Wasyi, S.Sos., M.Si
   • Kasubbag Rencana Program dan Penganggaran : Noor Leily, SP.,M.Si 
   • Kasubbag Evaluasi Pelaksana Program & Anggaran : Hanis Karmana, S.Kom., M.Si
2. Kabag Kerjasama : Achmadi, S.Sos., M.Si
   • Kerjasama,  BPKHM : Dewi Novi Rianti, SH., MH
   • Kasubbag HUMAS :Sigit Hadi Suyitno, SH

2. Lembaga Penelitian dan Pengabdian Masyarakat (LP2M) terdiri dari delapan pusat penelitian:

1. Pusat Penelitian Sumber Daya Alam dan Lingkungan
2. Pusat Kebijakan Publik dan Penelitian Pembangunan Daerah 
3. Pusat Penelitian Kesetaraan Gender dan Perlindungan Anak
4. Pusat Penelitian Pendidikan, Ilmu Sosial dan Humaniora
5. Pusat Penelitian Obat dan Kesehatan Masyarakat
6. Pusat Penelitian Pemberdayaan Kelembagaan dan Pemberdayaan Masyarakat
7. Pusat Publikasi Ilmiah dan Penelitian Hak Kekayaan Intelektual
8. Pusat Pengembangan Infrastruktur dan Penelitian Informasi Geospasial

3. Lembaga Pengembangan Pendidikan dan Penjaminan Mutu (LP3M) terdiri dari lima pusat:

1. Pusat Standar Mutu
2. Pusat Audit Internal dan Akreditasi
3. Pusat Data dan Informasi
4. Pusat Pelatihan Pengembangan Pendidikan
5. Pusat Pengembangan Kepribadian

4. Satuan Pengawas Internal (SPI):

• Ketua: Prof. Dr. H. Muhammad Noor, M.Si

5. Unit Pelaksana Teknis (UPT) terdiri dari tujuh unit:

1. UPT Perpustakaan
2. UPT Teknologi Informasi dan Komunikasi
3. UPT Laboratorium Sumber Daya Biologi Kalimantan
4. UPT Bahasa
5. UPT Pengembangan Karir dan Kewirausahaan 
6. UPT Layanan Internasional
7. UPT Kearsipan

6. Unit Layanan Strategis (ULS) terdiri dari empatbelas unit:

1. ULS PPBDSAL
2. ULS Perbatasan dan Pembangunan Daerah Unmul
3. ULS Pusat Penelitian & Pengembangan Pertanian & Pedesaan
4. ULS Ekosistem Tropis dan Pembangunan Berkelanjutan
5. ULS Perhutanan Sosial
6. ULS Badan Kajian Hukum dan Sosial Kemasyarakatan
7. ULS Pembangunan Ekonomi Regional dan Budaya
8. ULS Perpajakan
9. ULS Sains dan Keteknikan
10. ULS Pembangunan Ekonomi Unmul Syariah
11. ULS Lembaga Studi HUkum
12. ULS Halal Center
13. ULS Stakeholder Center
14. ULS Pengembangan Sumber Daya Daerah 
15. ULS Pusat Kajian Pengembangan Teknologi